MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia xenovorans LB400 chromosome 1

Total Repeats: 15227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007951	CGC	2	6	43	48	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007951	GCT	2	6	116	121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007951	TTG	2	6	129	134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007951	CG	5	10	135	144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007951	CCG	2	6	161	166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007951	A	6	6	1840	1845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007951	CGG	2	6	1923	1928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007951	CGG	2	6	1970	1975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007951	GC	3	6	2014	2019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007951	AC	3	6	3170	3175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007951	AGC	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007951	GCA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007951	A	6	6	3257	3262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007951	GTT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007951	CATC	2	8	5779	5786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007951	ATG	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007951	TGA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007951	GAAA	2	8	5851	5858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007951	CTG	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007951	GTTTT	2	10	5922	5931	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007951	CAG	2	6	7502	7507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007951	T	7	7	7535	7541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007951	ATTA	2	8	7562	7569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007951	CAG	2	6	7577	7582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007951	AAC	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007951	GCC	2	6	7603	7608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007951	CTT	2	6	7655	7660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007951	TGG	2	6	7751	7756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007951	AGTG	2	8	7757	7764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007951	GCT	2	6	7776	7781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007951	AATT	2	8	7798	7805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007951	CGC	2	6	7848	7853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_007951	TCTGC	2	10	7899	7908	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_007951	CTT	2	6	7923	7928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007951	CAAAA	2	10	7943	7952	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007951	A	6	6	7949	7954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007951	TGC	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007951	GTC	2	6	8115	8120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007951	AAG	2	6	8391	8396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007951	GCA	2	6	9078	9083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007951	TCGG	2	8	9109	9116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007951	GTG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007951	GCAG	2	8	9161	9168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007951	TCG	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007951	CAAA	2	8	9325	9332	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007951	GGGT	2	8	14295	14302	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007951	ATT	2	6	14356	14361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007951	CAAGC	2	10	14408	14417	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007951	CTC	2	6	15012	15017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007951	CGA	2	6	15029	15034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007951	AACG	2	8	16623	16630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007951	ACA	2	6	16635	16640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007951	ATT	2	6	18001	18006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007951	GAT	2	6	18376	18381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007951	GGC	2	6	19177	19182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007951	CGA	2	6	20793	20798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007951	CGC	2	6	20799	20804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007951	CAT	2	6	20824	20829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007951	ACC	2	6	20841	20846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_007951	ACT	2	6	20863	20868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007951	GGC	2	6	20873	20878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007951	GCG	2	6	21632	21637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007951	CGC	2	6	21662	21667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007951	CGC	2	6	21750	21755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007951	CAG	2	6	21869	21874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007951	TAC	2	6	21896	21901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007951	TATACA	2	12	21903	21914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007951	GC	3	6	21960	21965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007951	GGCA	2	8	21970	21977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007951	TTGC	2	8	22539	22546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007951	CGCTGA	2	12	22623	22634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007951	AAT	2	6	22662	22667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007951	ACT	2	6	22673	22678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007951	GCG	2	6	22718	22723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007951	CGG	2	6	22730	22735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007951	AGC	2	6	24178	24183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007951	A	7	7	26817	26823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007951	GAGC	2	8	26824	26831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007951	TG	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007951	CTC	2	6	28396	28401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007951	GC	3	6	28527	28532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007951	GAG	2	6	28551	28556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007951	GT	3	6	28578	28583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007951	TCA	2	6	28594	28599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007951	CG	3	6	29807	29812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007951	GCC	2	6	31987	31992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007951	GCA	2	6	31993	31998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007951	GCA	2	6	32001	32006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007951	GCA	2	6	32031	32036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007951	CTG	2	6	32051	32056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007951	GCA	2	6	32064	32069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007951	GCC	2	6	32071	32076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007951	GC	3	6	32096	32101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007951	GCC	2	6	32136	32141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007951	CGC	2	6	32144	32149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007951	CGT	2	6	32195	32200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007951	TGG	2	6	32264	32269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007951	GCC	2	6	32785	32790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007951	GGCCG	2	10	32819	32828	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007951	TTC	2	6	34619	34624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007951	TTC	2	6	34637	34642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007951	GGC	2	6	34676	34681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007951	GCG	2	6	34714	34719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007951	CCG	2	6	34782	34787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007951	GCA	2	6	34789	34794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007951	CCGT	2	8	34797	34804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007951	TCG	2	6	36047	36052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007951	GC	3	6	36068	36073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007951	AAGGGA	2	12	36099	36110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007951	GAT	2	6	36952	36957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007951	TGT	2	6	36962	36967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007951	GGCT	2	8	36977	36984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007951	T	6	6	38952	38957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007951	GCG	2	6	38998	39003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007951	GGCG	2	8	39028	39035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007951	CG	3	6	39113	39118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007951	AAC	2	6	39226	39231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007951	TGA	2	6	39266	39271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007951	GATA	2	8	39321	39328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007951	ACAAAT	2	12	39339	39350	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007951	TG	3	6	39408	39413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007951	CT	3	6	41990	41995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007951	GAT	2	6	42001	42006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007951	CCGCG	2	10	42021	42030	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_007951	TGG	2	6	42051	42056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007951	GCGCG	2	10	42241	42250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007951	CG	4	8	42247	42254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007951	ACCG	2	8	44658	44665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007951	ATGA	2	8	50691	50698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007951	GGT	2	6	50714	50719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007951	TGAAG	2	10	50737	50746	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007951	CGG	2	6	50789	50794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007951	GCAA	2	8	50809	50816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007951	TGG	2	6	50862	50867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007951	GTGA	2	8	50871	50878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007951	GCT	2	6	50910	50915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007951	CG	3	6	51115	51120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007951	CGGCG	2	10	52472	52481	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007951	CGA	2	6	52495	52500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007951	GCG	2	6	52501	52506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007951	AAAG	2	8	52529	52536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007951	AGC	2	6	53667	53672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007951	TTG	2	6	53731	53736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007951	GAA	2	6	53862	53867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007951	T	7	7	53908	53914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007951	CGG	2	6	57297	57302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007951	A	6	6	57310	57315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_007951	T	6	6	57342	57347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007951	GGC	2	6	57367	57372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_007951	CG	3	6	65829	65834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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184	NC_007951	CTT	2	6	65867	65872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_007951	CG	3	6	65900	65905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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264	NC_007951	GCC	2	6	95228	95233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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274	NC_007951	A	6	6	101137	101142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_007951	AG	3	6	101175	101180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
276	NC_007951	ACC	2	6	101224	101229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_007951	CTT	2	6	101717	101722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_007951	ACGG	2	8	101809	101816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
283	NC_007951	CTC	2	6	101886	101891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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285	NC_007951	GC	4	8	102294	102301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_007951	CAG	2	6	102309	102314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_007951	GCCGC	2	10	102325	102334	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
288	NC_007951	GGGC	2	8	103522	103529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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290	NC_007951	GCCGG	2	10	103582	103591	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
291	NC_007951	GC	3	6	103597	103602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
292	NC_007951	CGG	2	6	103630	103635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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402	NC_007951	C	6	6	137997	138002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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409	NC_007951	GGGA	2	8	139606	139613	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
410	NC_007951	CA	4	8	139658	139665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
411	NC_007951	AGC	2	6	139667	139672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_007951	CGG	2	6	139685	139690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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414	NC_007951	AATGC	2	10	141249	141258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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417	NC_007951	GAT	2	6	141451	141456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NC_007951	ATG	2	6	141518	141523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
419	NC_007951	GAA	2	6	141546	141551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
420	NC_007951	A	6	6	141601	141606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_007951	CTT	2	6	142441	142446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_007951	GGC	2	6	142466	142471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_007951	GTC	2	6	142474	142479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_007951	GCCG	2	8	142484	142491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
425	NC_007951	TGC	2	6	142507	142512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_007951	CTG	2	6	142820	142825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_007951	CG	3	6	142913	142918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
428	NC_007951	GCG	2	6	143042	143047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_007951	TGAACC	2	12	143049	143060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_007951	CG	3	6	143080	143085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
432	NC_007951	CGC	2	6	143100	143105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_007951	CCG	2	6	143112	143117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_007951	CTG	2	6	145097	145102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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437	NC_007951	TTCG	2	8	146868	146875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_007951	TCC	2	6	148188	148193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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447	NC_007951	GCCG	2	8	148237	148244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
448	NC_007951	CCCGA	2	10	148255	148264	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
449	NC_007951	ATT	2	6	148272	148277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_007951	ATT	2	6	148287	148292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_007951	GTG	2	6	149432	149437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_007951	TAA	2	6	149451	149456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_007951	CG	3	6	149471	149476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
455	NC_007951	CGAT	2	8	149500	149507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
456	NC_007951	CA	3	6	149513	149518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_007951	TAT	2	6	149535	149540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_007951	TAA	2	6	149541	149546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_007951	CCG	2	6	149600	149605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
461	NC_007951	GCC	2	6	149667	149672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_007951	TCCG	2	8	149674	149681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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467	NC_007951	CAA	2	6	152252	152257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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